Struktur Organisasi pada Inspektorat Kabupaten Magetan terdiri atas :

  1. Inspektur Kabupaten Magetan
  2. Sekretaris, yang membawahi :
    • Sub Bagian Administrasi dan Umum
    • Sub Bagian Perencanaan
    • Sub Bagian Evaluasi dan Pelaporan
  3. Inspektur Pembantu
  4. Kelompok Jabatan Fungsional .